Vpr-mediated induction of apoptosis by mitochondrial outer membrane permeabilization

tRNA 衍生小 RNA（tsRNAs）是特定细胞类型中观察到的 tRNA 片段，通常在暴露于性激素或应激（如缺氧、饥饿、氧化应激和病毒感染）时产生（参见 Keam and Hutvagner 2015, Kumar et al. 2016, Oberbauer and Schaefer 2018, Park et al. 2020, Su et al. 2020, Xie et al. 2020, Zhu et al. 2020）。tsRNAs 并非 tRNA 降解的随机产物，而是由核糖核酸酶特异性产生的。已描述两类 tsRNAs：(1) 较长（31-40nt）的 tsRNAs，称为 tRNA 半或应激诱导 tsRNAs（tiRNAs），由 tRNA 在反密码子附近或内部单链切割产生；(2) 较短（15-30nt）的 tsRNAs，称为 tRNA 相关片段（tRFs），由 tRNA 5' 或 3' 端附近切割产生。tRF-3s 源自 tRNA 的 3' 区域（T 环至 3' 末端），tRF-5s 源自 5' 区域（D 环至 5' 末端）。tRF2 型 tRFs（也称为内部 tRFs）源自 tRNA 中央区域（D 环与 T 环之间），包含反密码子。tRF-1s（也称为 Type II tRFs 或 3'U tRFs）是特定 tRNA 的 3' 拖尾，在加工后仍存在于细胞质中。大多数情况下，负责切割的酶尚未完全确定，但已识别几种参与 tRNA 切割的核糖核酸酶：分泌型内吞型核糖核酸酶 A 家族成员 angiogenin（ANG）和 RNase 1；干扰素诱导的核糖核酸酶 RNase L、Schlafen 11（SLFN11）和 Schlafen13（SLFN13 或 RNase S13）；胞质核糖核酸酶 III 样（双链 RNA 特异性）酶 DICER1；以及 RNA 加工酶 ELAC2。ANG 被分泌并内吞，随后转运至细胞核，在细胞质中短暂存在时切割反密码子环，产生 tRNA 半，切割被认为发生在 ANG 暂时位于细胞质的过程中（Lee and Vallee 1989, Saxena et al. 1992, Fu et al. 2009, Yamasaki et al. 2009, Emara et al. 2010, Ivanov et al. 2011）。ANG 切割在饥饿等细胞应激下观察到（Fu et al. 2009, Yamasaki et al. 2009, Emara et al. 2010, Ivanov et al. 2011）。然而，ANG 敲除细胞仍产生应激诱导的 tRNA 半，表明其他酶也参与半的产生（Su et al. 2019）。与 ANG 作为 RNase A 家族成员类似，分泌型内切核糖核酸酶 RNase 1 在细胞外空间切割 tRNA 的反密码子环（Nechooshtan et al. 2020）。干扰素诱导的核糖核酸酶也可切割 tRNA。RNase L 对双链 RNA 敏感，在 tRNA 反密码子环处切割（Donovan et al. 2017）。Schlafen 家族成员 SLFN11 和 SLFN13 也可切割 tRNA（Li et al. 2018, Yang et al. 2018）。DICER1 切割 tRNA 的双链区域靠近 5' 末端或 3' 末端，产生短 tRFs（Cole et al. 2009, Yeung et al. 2009, Maute et al. 2013, Hasler et al. 2016）。DICER1 产生的双链产物的解离机制以产生单链 tRFs 的方式可能与 miRNAs 相同，但尚未证明。此外，在 DICER1 缺失细胞中仍检测到大量短 tRFs（Kumar 2014, Kuscu & Kumar et al. 2018），表明其生物发生涉及其他未知因素。胞质中的 ELAC2 切割 tRNA Ser TGA、tRNA Ser GTC 和 tRNA Asp GTC 的 3' 拖尾，tRF-1s 随后在细胞质中持续存在（Kumar et al. 2014）。