非同源末端连接(NHEJ)
中文名称
通路描述
非同源末端连接(NHEJ)通路是在 DNA 双链断裂(DSBs)诱导的 DNA 损伤反应中启动的,例如由电离辐射引起。MRN 复合物(MRE11A:RAD50:NBN)识别 DNA DSBs,导致 ATM 激活,并招募多种 DNA 损伤检查点和修复蛋白到 DNA DSB 位点(Lee and Paull 2005)。ATM 磷酸化的 MRN 复合物、MDC1 和 H2AFX 含核小体(γ-H2AX)作为支架,形成被称为电离辐射诱导聚集体(IRIF)的核聚集体(Gatei et al. 2000, Paull et al. 2000, Stewart et al. 2003, Stucki et al. 2005)。最终,BRCA1:BARD1 异二聚体和 TP53BP1(53BP1)被招募到 IRIF(Wang et al. 2007, Pei et al. 2011, Mallette et al. 2012),这对于 ATM 介导的 CHEK2 激活是必要的(Wang et al. 2002, Wilson et al. 2008)。在 G1 细胞中,TP53BP1 通过招募 RIF1 和 PAX1IP 促进 NHEJ,从而将 BRCA1:BARD1 及相关蛋白从 DNA DSB 位点置换开,并防止 DNA DSB 的切除,这是同源重组修复(HRR)所必需的(Escribano-Diaz et al. 2013, Zimmermann et al. 2013, Callen et al. 2013)。TP53BP1 还参与 ATM 介导的 DCLRE1C(ARTEMIS)磷酸化(Riballo et al. 2004, Wang et al. 2014)。Ku70:Ku80 异二聚体(也称为 Ku 复合物或 XRCC5:XRCC6)结合 DNA DSB 末端,与 MRN 复合物竞争,防止 MRN 介导的 DNA DSB 末端切除(Walker et al. 2001, Sun et al. 2012)。然后,DNA 依赖性蛋白激酶(DNA-PKcs, PRKDC)的催化亚基被招募到 DNA 结合的 Ku 上形成 DNA-PK 全酶。两个 DNA-PK 复合物,一个在断裂处两侧,将 DNA DSB 末端拉近,形成突触复合物(Gottlieb 1993, Yoo and Dynan 2000)。DNA-PK 复合物招募 DCLRE1C(ARTEMIS)到 DNA DSB 末端(Ma et al. 2002)。PRKDC 介导的 DCLRE1C 磷酸化以及 PRKDC 自磷酸化使 DCLRE1C 能够修剪 DNA DSB 末端的 3'-和 5'-悬突,为连接做准备(Ma et al. 2002, Ma et al. 2005, Niewolik et al. 2006)。inositol 磷酸的结合可能还刺激 PRKDC 的催化活性(Hanakahi et al. 2000)。其他因素,如多核苷酸激酶(PNK)、TDP1 或 TDP2,可以移除 5'-和 3'端的不可连接受损核苷酸,将其转化为可连接底物(Inamdar et al. 2002, Gomez-Herreros et al. 2013)。DNA 连接酶 4(LIG4)与 XRCC4(XRCC4:LIG4)复合物被招募到可连接的 DNA DSB 末端,与 XLF(NHEJ1)同源二聚体、DNA 聚合酶 μ(POLM)和/或 λ(POLL)一起(McElhinny et al. 2000, Hsu et al. 2002, Malu et al. 2002, Ahnesorg et al. 2006, Mahajan et al. 2002, Lee et al. 2004, Fan and Wu 2004)。在 POLL 和/或 POLM 填充 1-或 2 个核苷酸长的单链缺口后,XRCC4:LIG4 执行断裂 DNA 链的连接,从而完成 NHEJ。NHEJ1 同源二聚体的存在促进连接步骤,特别是在错配 DSB 末端(Tsai et al. 2007)。根据 DNA DSBs 中存在的其他 DNA 损伤类型,NHEJ 可能导致无错误产物、产生带有微缺失和/或错配碱基的 dsDNA,或导致易位(综述由 Povrik et al. 2012)。
英文描述
Mitochondrial translation initiation Translation initiates with the mitochondrial mRNA binding the 28S subunit:MTIF3 (28S subunit:IF-3Mt, 28S subunit:IF3mt) complex together with MTIF2:GTP (IF-2Mt:GTP, IF2mt:GTP) (reviewed in Christian and Spremulli 2012, Kuzmenko et al. 2014). As inferred from bovine homologs, the 28S subunit, 39S subunit, and 55S holoribosome associate with the matrix-side face of the inner membrane and the translation products are inserted into the inner membrane as translation occurs (Liu and Spremulli 2000). Mitochondrial mRNAs have either no untranslated leader or short leaders of 1-3 nucleotides, with the exception of the 2 bicistronic transcripts, RNA7 and RNA14, which have overlapping orfs that encode ND4L/ND4 and ATP8/ATP6 respectively.. Binding of N-formylmethionine-tRNA to the start codon results in a stable complex between the mRNA and the 28S subunit while absence of a start codon at the 5' end of the mRNA causes the mRNA to slide though the 28S subunit and eventually dissociate. The 39S subunit then binds the 28S subunit:mRNA complex, GTP is hydrolyzed, and the initiation factors MTIF3 and MTIF2:GDP dissociate.
所含基因
88 个基因
AURKAIP1
CHCHD1
DAP3
ERAL1
GADD45GIP1
ICT1
MRPL1
MRPL10
MRPL11
MRPL12
MRPL13
MRPL14
MRPL15
MRPL16
MRPL17
MRPL18
MRPL19
MRPL2
MRPL20
MRPL21
MRPL22
MRPL23
MRPL24
MRPL27
MRPL28
MRPL3
MRPL30
MRPL32
MRPL33
MRPL34
MRPL35
MRPL36
MRPL37
MRPL38
MRPL39
MRPL4
MRPL40
MRPL41
MRPL42
MRPL43
MRPL44
MRPL45
MRPL46
MRPL47
MRPL48
MRPL49
MRPL50
MRPL51
MRPL52
MRPL53
MRPL54
MRPL55
MRPL57
MRPL9
MRPS10
MRPS11
MRPS12
MRPS14
MRPS15
MRPS16
MRPS17
MRPS18A
MRPS18B
MRPS18C
MRPS2
MRPS21
MRPS22
MRPS23
MRPS24
MRPS25
MRPS26
MRPS27
MRPS28
MRPS30
MRPS31
MRPS33
MRPS34
MRPS35
MRPS36
MRPS5
MRPS6
MRPS7
MRPS9
MTFMT
MTIF2
MTIF3
OXA1L
PTCD3