Resolution of D-loop Structures through Synthesis-Dependent Strand Annealing (SDSA)

人类细胞含有超过 60 种 RAB 蛋白，参与内吞溶酶体系统中蛋白质的运输。这些小 GTP 通过定位到不同内吞 Compartments 的膜并相互作用，如分拣适配体、锚定因子、激酶、磷酸酶和管状 - 囊泡性货物，来实现运输特异性（参考 Stenmark 等，2009; Wandinger-Ness 和 Zerial，2014）。RAB 的定位依赖于多种因素，包括 C 端泛糖基化、上游超变区的序列以及结合核苷酸的状态（参考 Chavrier 等，1991; Ullrich 等，1993; Soldati 等，1994; Farnsworth 等，1994; Seabra，1996; Wu 等，2010; 参考 Stenmark，2009; Wandinger-Ness 和 Zerial，2014）。在活性、GTP 结合形式下，泛糖基化的 RAB 蛋白是膜结合的，而在无活性的 GDP 结合形式下，RAB 从目标膜中被提取，与 GDP 解离抑制剂（GDIs）形成可溶性复合物（参考 Ullrich 等，1993; Soldati 等，1994; Gavriljuk 等，2010）。活性与无活性形式之间的转换依赖于 RAB 鸟苷酸交换因子（GEF）和 GTP 酶激活蛋白（GAP）的活动（参考 Yoshimura 等，2010; Wu 等，2011; Pan 等，2006; Frasa 等，2012; 参考 Stenmark，2009; Wandinger-Ness 和 Zerial，2014）。新合成的 RAB 蛋白由 RAB 护送蛋白 CHM（也称为 REP1）或 CHML（REP2）结合。CHM/REP 蛋白是三聚体 RAB 泛糖基转移酶（GGTaseII）的底物结合组分，与两个催化亚基 RABGGTA 和 RABGGTB 一起（参考 Gutkowska 和 Swiezewska，2012; Palsuledesai 和 Distefano，2015）。REP 蛋白招募未修饰的 RAB 蛋白在 GDP 结合状态下，将其递送至 GGTase 酶，进行一个或两个 C 端半胱氨酸残基上的顺序泛糖基化（参考 Alexandrov 等，1994; Seabra 等，1996; Shen 和 Seabra，1996; Baron 和 Seabra，2008）。泛糖基化后，CHM/REP 蛋白与泛糖基化的 RAB 蛋白保持复合物，并将其护送至其目标膜，其活性由 GAP、GEF、GDIs 和膜结合 GDI 置换因子（GDF）调节（参考 Sivars 等，2003; 参考 Stenmark，2009; Wandinger-Ness 和 Zerial，2014）。