WDR5 含组蛋白修饰复合物的形成
中文名称
通路描述
WDR5 是六种哺乳动物组蛋白甲基转移酶 KMT2 复合物的组成部分:混合 lineage 白血病 (MLL) 1-4、SET1A 和 SET1B。所有 KMT2 复合物均由一个组蛋白甲基转移酶(KMT2A、KMT2B、KMT2C、KMT2D、SETD1A 或 SETD1B,分别对应)和 WRAD 亚基复合物组成,WRAD 亚基复合物由 WDR5、RBBP5、ASH2L 和 DPY30 组成。WRAD 复合物调节组蛋白甲基转移酶的酶活性,并使其招募到染色质。此外,每个 KMT2 组蛋白甲基转移酶复合物还结合转录辅助因子,实现其功能多样化。详细概述请参见 Cho 等人 2007、Song 和 Kingston 2008、Takahashi 等人 2011、Couture 和 Skiniotis 2013、van Nuland 等人 2013、Klonou 等人 2021。KMT2 复合物在进化上保守。虽然酵母中存在一个单一的 SET1/COMPASS 复合物,但果蝇中存在三个不同的复合物:trithorax (Trx)、trithorax-related (Trr) 和 Set1。在哺乳动物中,由于基因重复,形成了两个 Trx 样复合物(一个以 KMT2A 为催化亚基,另一个以 KMT2B 为催化亚基)和两个 Trr 样复合物(一个以 KMT2C 为催化亚基,另一个以 KMT2D 为催化亚基)以及两个 Set1 样复合物(一个以 SETD1A 为催化亚基,另一个以 SETD1B 为催化亚基)。对于综述,请参见 Rao 和 Dou 2015。所有 KMT2 复合物均对组蛋白 H3 的赖氨酸 K5 进行甲基化(成熟组蛋白 H3 肽链中的 K4,因为起始甲硫氨酸被移除),这与转录激活相关。不同的 KMT2 复合物根据辅助亚基、转录共因子和翻译后修饰的存在情况,偏好单甲基化、二甲基化或三甲基化 H3K4。KMT2 复合物的催化活性可能在内源性复合物和体外由哺乳动物蛋白表达的细菌或昆虫细胞中重构的复合物之间有所不同。KMT2A 和 KMT2B 复合物偏好有限数量的目标基因启动子处甲基化 H3K4,而 KMT2C 和 KMT2D 复合物偏好有限数量的目标基因增强子处甲基化 H3K4。SETD1A 和 SETD1B 复合物负责细胞内 H3K4 甲基化的大部分,且目标特异性较低。对于概述,请参见 Patel 等人 2009、Wang 等人 2009、Rao 和 Dou 2015。在果蝇和脊椎动物中,KMT2 复合物控制进化上保守的 Hox 基因的表达,这些基因作为胚胎模式形成的主要调节因子(综述:Soshnikova 和 Duboule 2009)。人类 KMT2 复合物的体细胞突变是多种染色质病的根本原因。体细胞 KMT2 基因突变最初在混合 lineage 白血病 (MLL) 中被发现,其特征是涉及 KMT2A 基因位点(第 11 号染色体第 11q23 区带)的染色体易位,导致表达具有致癌性质的融合蛋白。除了基因融合外,血癌(最常见于高级别 B 细胞淋巴瘤、T 细胞淋巴样白血病和急性髓系白血病)和实体瘤(最常见于肺腺癌、结肠腺癌和膀胱尿路上皮癌)中还存在 KMT2A 的其他类型突变。其他 KMT2 基因(KMT2B、KMT2C、KMT2D、SETD1A 和 SETD1B)的体细胞癌症突变特征较少,但最常影响催化 SET 结构域,并在不同癌症类型中表现出不同的分布。对于综述,请参见 Rao 和 Dou 2015、Castiglioni 等人 2022。正在开发的抗癌疗法影响 KMT2 酶与 WRAD 复合物成分(特别是 WDR5)的结合(综述:Vedadi 等人 2017;Siladi 等人 2022)。WDR5 也是组蛋白乙酰转移酶复合物的组成部分:GCN5-ATAC、PCAF-ATAC 和 MOF/KAT8-NSL。WDR5 在通过组蛋白乙酰化调节基因表达的表观遗传调控中的作用正在研究中(综述:Guarnaccia 和 Tansey 2018)。WDR5 含组蛋白修饰复合物的功能目前描绘在以下 Reactome 通路中:“粒细胞分化转录调控”(MLL1 复合物)、“RUNX1 介导的转录调控”(MLL1 复合物)、“早期胚胎发育期间 hindbrain 发育中前 Hox 基因激活”(MLL3 复合物和 MLL4 复合物)、“WNT 信号转导中的 TCF 依赖性信号”(MLL4 复合物)和“染色质组织”(MLL1 复合物、MLL2 复合物、MLL3 复合物、MLL4 复合物、SET1A 复合物、SET1B 复合物、GCN5-ATAC 复合物、PCAF-ATAC 复合物和 MOF/KAT8-NSL 复合物)。请注意,文献和 Reactome 通路中 MLL2 和 MLL4 复合物的命名存在不一致,MLL2 和 MLL4 分别被用作 KMT2B 和 KMT2D 的同义词,这取决于 MLL 编号是指克隆顺序还是指与奠基性 MLL1(MLL、KMT2A)酶相似性。UniProt 标准目前规定 MLL2 应作为 KMT2B 的首选同义词,MLL4 应作为 KMT2D 的首选同义词。
英文描述
Translation of respiratory syncytial virus mRNAs The 10 subgenomic mRNAs of human respiratory syncytial virus A (hRSV A) are translated into 11 proteins. Except for the M2 mRNA, each mRNA encodes one distinct protein. The two overlapping open reading frames (ORFs) of the M2 mRNA encode proteins M2-1 and M2-2. The M2-1 product of the M2 gene is a transcription processivity factor, while the M2-2 product of the M2 gene is a nonstructural protein that regulates the switch between transcription and genome replication. The N mRNA encodes the nucleoprotein, which forms decameric and hendecameric rings around which viral genomic RNA is packaged. The L and P mRNAs encode the large polymerase subunit and the phosphoprotein polymerase cofactor subunit, respectively, of the RNA-dependent RNA polymerase complex (RdRP). The SH, G, and F mRNAs encode three proteins that are embedded in the viral envelope: small hydrophobic protein, attachment protein, and fusion protein, respectively. The secreted isoform of G protein (sG), involved in mediation of immune evasion, and the truncated form of SH (SHt), are translated from G mRNA and SH mRNA, respectively, through the usage of an alternative start codon. The NS1 and NS2 genes encode nonstructural proteins that function together to inhibit apoptosis and interferon response in infected cells. For review, please refer to Battles and McLellan 2019.
所含基因
2 个基因