衰老相关异染色质聚集体（SAHF）的形成

中文名称

通路描述

DNA 损伤/端粒压力诱导的衰老过程最终导致衰老相关异染色质聚集体（SAHF）的形成。这些聚集体代表在衰老细胞中形成的可 facultative 异染色质。它们有助于抑制增殖促进基因的表达，并在衰老所特有的永久性细胞周期退出中发挥重要作用（Narita et al. 2003 和 2006）。SAHF 表现为致密的、点状的 DAPI 染色的 DNA 聚集体。每条染色体被凝聚成一个 SAH 聚集体，端粒和着丝粒染色质主要位于其周围（Funayama et al. 2006, Zhang et al. 2007）。一个进化上保守的 HIRA、ASF1A、UBN1 和 CABIN1 蛋白复合物在 SAHF 形成中起关键作用。随着细胞接近衰老状态，HIRA、ASF1A、UBN1 和 CABIN1 在 PML 体（Zhang et al. 2005, Banumathy et al. 2009, Rai et al. 2011）中积累。PML 体是含有 PML 蛋白和其他多种蛋白的核内点状结构，被认为是大分子调节复合物和蛋白质修饰的组装位点（Fogal et al. 2000, Guo et al. 2000, Pearson et al. 2000）。HIRA 向 PML 体的招募与染色质结构改变和宏 H2A 组蛋白变体沉积有关。随着细胞衰老，HIRA、ASF1A、UBN1 和 CABIN1 从 PML 体迁移到 SAHF。HIRA 在 PML 体的积累与 RB1 和 TP53 无关，但可能需要 GSK3B 磷酸化 HIRA 丝氨酸 S697（Ye, Zerlanko, Kennedy et al. 2007）。然而，SAHF 的形成本身需要功能正常的 RB1 和 TP53 通路（Ye, Zerlanko, Zhang et al. 2007）。SAHF 含有 H3K9Me 标记，这是转录沉默染色质的特征，HP1、macroH2A 组蛋白变体 HMGA 蛋白也是 SAHF 的成分（Narita et al. 2006），除了 HIRA:ASF1A:UBN1:CABIN1 复合物。UBN1 可能招募一个尚未鉴定的 H3K9Me 组蛋白甲基转移酶到 SAHF 中（Banumathy et al. 2009）。HIRA:ASF1A:UBN1:CABIN1 复合物的一个功能是向染色质沉积 H3.3 变体，从而影响基因表达（Zhang et al. 2007, Rai et al. 2011）。需要进一步的研究来完全阐明 SAHF 形成的机制以及 SAHF 促进细胞衰老的机制。

英文描述

CHD1 and CHD2 subfamily CHD subfamily I members CHD1 and CHD2 act as monomeric ATP-dependent chromatin remodellers (reviewed in Alendar and Berns, 2021; Clapier et al, 2017). Human CHD1 and CHD2 are characterized by the presence of double chromodomains at the N-terminal, and central SNF2 helicase ATPase domain, and a C-terminal SANT-SLIDE DNA binding domain (reviewed in Alendar and Berns, 2021; Li et al, 2023). They are 60% identical and 80% similar at the amino acid level (Liu et al, 2015) but have significantly divergent C-terminal regions that may contribute to different functions. Both proteins have been shown to bind to H3K4me3, albeit with different affinities (Sims et al, 2005; Sims et al, 2007; Flanagan et al 2007; Flanagan et al, 2005) and to possess in vitro and in vivo ATP-dependent chromatin remodelling activity (Luijsterberg et al, 2016, Tran et al, 2000; reviewed in Alendar and Berns, 2021; Li et al, 2023). Both proteins are associated with transcriptionally active regions of the genome and may play a role in histone H3.3 deposition (Harada et al, 2012; Konev et al, 2007; reviewed in Alendar and Berns, 2021).

所含基因

69 个基因

CDC73 CHD1 CHD2 CHERP CTR9 DDX42 DDX46 DHX15 H2AFB1 H2AFJ H2AFV H2AFX H2BFS H3F3A HIST1H2AB HIST1H2AC HIST1H2AD HIST1H2AJ HIST1H2BA HIST1H2BB HIST1H2BC HIST1H2BD HIST1H2BH HIST1H2BJ HIST1H2BK HIST1H2BL HIST1H2BM HIST1H2BN HIST1H2BO HIST1H3A HIST1H4 HIST2H2AA3 HIST2H2AC HIST2H2BE HIST2H3A HIST3H2BB LEO1 MYOD1 MYOG PAF1 PHF5A PUF60 RBM17 RTF1 SF3A1 SF3A2 SF3A3 SF3B1 SF3B2 SF3B3 SF3B4 SF3B5 SF3B6 SMNDC1 SNRPA1 SNRPB SNRPB2 SNRPD2 SNRPE SNRPF SNRPG SNRPN SSRP1 SUPT16H TCF12 TCF3 TCF4 U2SURP WDR61