Apoptosis - multiple species

该 COVID-19 通路结合了来自 SARS-CoV-1 数据的计算推断（https://reactome.org/documentation/inferred-events）和手动校订，具体描述见 SARS-CoV-2 整体感染通路的汇总。直接研究的步骤包括 RTC 结合 RNA 模板、nsp12 的聚合酶活性（Hillen et al. 2020, Wang et al. 2020, Yin et al. 2020）、nsp13 的解旋酶活性（Chen et al. 2020, Ji et al. 2020, Shu et al. 2020）、nsp16 的加帽活性（Viswanathan et al. 2020）以及 SARS-CoV-2 基因组 RNA 的 polyadenylation（Kim et al. 2020）。复制发生在由 ER 膜扭曲形成的双膜囊泡（DMVs）中（Cortese et al, 2020; Snijder et al, 2020）。形成这些复制器器的一个宿主因子是磷脂酰肌酸（Tabata et al, 2021）。其他步骤是从 SARS-CoV-1 及相关冠状病毒的先前研究中推断的。人类 SARS-CoV-1 的 plus 链 RNA 基因组由由非结构蛋白 nsp3-nsp16 组成的病毒复制 - 转录复合物（RTC）复制，该复合物由开放阅读框 ORF1a 和 ORF1b 编码。两个 RTC 蛋白 nsp8 和 nsp12 具有 5'-3' RNA 依赖的 RNA 聚合酶活性。nsp12 是主要的 RNA 聚合酶，而 nsp8 被认为作为 RNA 引物酶起作用。nsp14 作为 3'-5' 外切酶，增加了 RTC 的保真度。nsp14 还具有 RNA 加帽活性，与 nsp16 协同作用，为病毒 plus 链和 minus 链基因组及亚基因组 RNA 加帽，从而通过使它们能够逃避免疫介导的宿主先天免疫反应而赋予病毒 RNA 稳定性。nsp13 是 RNA 解旋酶，被认为在复制和转录期间熔解基因组 RNA 中的二级结构。plus 链基因组 RNA 首先用于合成 minus 链基因组 RNA 互补体，随后作为模板合成 plus 链病毒 RNA 基因组，这些基因组被包装到成熟的病毒颗粒中。如需综述，请参考 Yang and Leibowitz 2015, Snijder et al. 2016, Fung and Liu 2019。